生殖系统检查可以做体格检查、实验室检查和影像学检查，具体如下：

一、体格检查：针对女性患者可以通过视诊观察其外生殖道否存在溃疡、出血、化脓、畸形等情况，通过触诊可以明确其阴道内部是否存在肿块、硬结等异常表现。还可以通过体格检查对男性的生殖系统进行检查，如是否存在包皮过长、外生殖器畸形等。

二、实验室检查：实验室检测通常包括白带常规、精液检查、激素水平检测等。白带常规是通过观察白带的性状、颜色及检测含有的病原菌类型，判断是发生否霉菌性阴道炎、细菌性阴道炎等妇科疾病。男性通过精液检查能判断自身的生育能力，检查内容包括精液颜色、酸碱度、粘稠度等。女性可以测定黄体生成素、雌二醇、卵泡刺激素等性激素水平，判断是否发生了月经不调等疾病。男性可以测定雄激素睾酮含量的高低，判断是否发生内分泌性性功能障碍等疾病。

三、影像学检查：患者可以根据病情做B超、超声、输卵管碘油造影等检查。女性做腹部或阴道B超，能发现盆腔内的占位性病变和积液等病变。而男性B超检查能发现前列腺是否有囊肿、结石、钙化及脓肿等病变。男性做超声检查可用于检查阴囊血肿、睾丸损伤等病变，而女性通过超声检查能发现输尿管囊肿、子宫肌瘤等疾病。当女性怀疑输卵管存在堵塞时，可以做输卵管碘油造影。