妇科支原体、衣原体感染，多选用抗生素药物，（比如四环素类、喹诺酮类、大环内酯类）进行治疗，以消除致病菌为主。

临床一般首选四环素类，属于快速抑菌剂，高浓度时具有杀菌作用，可广泛应用于支原体、衣原体所致感染，如盐酸米诺环素胶囊、盐酸美他环素胶囊、盐酸多西环素肠溶胶囊等。

喹诺酮类主要选用第3代、第4代的药物，具有抗菌活性高、抗菌谱广、渗透力强、使用方便、副作用少等特点，现已成为临床常用抗生素，比如盐酸莫西沙星片、加替沙星胶囊、盐酸洛美沙星片等。

大环内酯类抗生素具有口服吸收好、半衰期长、耐药发生率低等特点，主要应用于革兰阳性和阴性球菌、厌氧菌、衣原体、支原体等感染，比如阿奇霉素片、克拉霉素胶囊、罗红霉素分散片等。