大脚趾盖凹凸不平，可能是外伤、营养元素缺乏、甲癣等导致的，建议查明原因后进行对应处理，具体如下：

1、外伤：大脚趾甲受到外部撞击或硬物砸伤，可导致甲床、甲板受损，可导致甲板产生的指甲凹凸不平。如果没有疼痛感和其它不适，不需要药物治疗，过一段时间后新长出的大脚趾盖会恢复正常；但如果部分患者受伤严重可导致软组织损伤或者骨折脱位，应先对伤口进行清洁，再应用碘伏消毒液处理伤口，如伤口深度较深，还需注射破伤风抗毒素针，后续过程中需要冷敷制动，将患肢抬高；如发生骨折脱位，还需要进行手法复位外固定或者切开复位内固定，恢复骨折端稳定性。

2、营养元素缺乏：指甲的生长需要很多的营养物质才能变得光滑坚硬，如指甲缺乏蛋白质、维生素（维生素A、维生素B）、钙、微量元素（铁、锌）等营养元素时可导致大脚趾盖凹凸不平。患者应注意营养均衡，不要挑食，多吃高蛋白的食物，如鸡蛋、牛奶、瘦肉及含有钙、铁、锌的食物，还有富含维生素A、维生素B的食物，如胡萝卜、动物的肝脏、绿色蔬菜等。如相关营养元素缺乏严重甚至伴有其他症状，可遵医嘱使用维生素A软胶囊、维生素AD软胶囊、复合维生素B片、葡萄糖酸钙片、琥珀酸亚铁片、葡萄糖酸锌口服溶液等。

3、甲癣：通常由皮肤癣菌感染所引起，多由手足癣直接传染导致，患者的大脚趾盖可以表现为表面凹凸不平，还可出现大脚趾盖浑浊、增厚、分离、变色、钩甲以及甲沟炎等症状，患者自觉症状轻微，也可出现疼痛和甲下出血。患者确诊后可遵医嘱使用硝酸咪康唑乳膏、复方醋酸氟轻松酊、环吡酮胺乳膏等药物，也可遵医嘱使用抗真菌药物，如伊曲康唑胶囊、伏立康唑片、盐酸特比萘芬片等。