引起肠胃不舒服的病因有很多，只有针对病因治疗，才可以取得良好的治疗效果。引起胃不舒服的，常见于功能性消化不良或者是慢性胃炎、胃食管反流病、消化性溃疡、胃部肿瘤，如胃癌、胃淋巴瘤等。患者可以做胃镜检查，明确诊断。引起慢性胃病的病因，常常是幽门螺杆菌感染。患者可以做碳13或碳14呼气试验检查，明确有无幽门螺杆菌感染。如果结果阳性，可以选择四联方案，根除幽门螺杆菌治疗，就是一种PPI加两种抗菌素加一种铋剂，疗程是7-14天。经过有效的根除幽门螺杆菌治疗之后，可以迅速缓解症状。如果幽门螺杆菌感染阴性，可以选择PPI类药物、H2受体阻滞剂、胃粘膜保护药、促胃肠动力药和助消化药等，进行治疗。

肠道病变常见于肠结核、炎症性肠病、结肠癌、肠易激综合征等。患者可以做肠镜检查，明确诊断，再针对病因做相对应的治疗。肠结核需要抗结核治疗；炎症性肠病需要使用水杨酸类药物、糖皮质激素、免疫抑制剂治疗；结肠癌需要手术治疗，不能手术的晚期结肠癌，需要用化疗；肠易激综合征患者，治疗主要是积极寻找并去除触发因素和对症治疗，强调综合治疗和个体化治疗的原则。