拔牙后第三天比第二天痛，可能是由术后生理性疼痛、感染、干槽症等原因导致的，应该根据不同病因采取不同治疗措施：

1、正常的术后生理性疼痛：如果手术历时较长，创伤较大，术后疼痛会在2-3天达到高峰，之后会逐渐缓解。若没有合并其他症状，比如口腔异味、拔牙创溢脓等情况，可再观察一天疼痛是否缓解，有所缓解后可适当口服布洛芬片止痛。疼痛持续加剧，建议口腔科门诊就诊进一步检查创面情况。

2、术后感染：手术创面大，术后护理不当导致创口感染，表现为创面局部肿胀，疼痛，或有脓液，这种情况需要在医生指导下，使用甲硝唑、布洛芬胶囊、头孢克肟片抗炎治疗，一般3-4天症状可以缓解。

3、干槽症：术后剧烈运动，漱口等行为使创面血凝块脱落，或局部感染加重都会导致干槽症。干槽症术后疼痛会逐渐加剧，患侧耳颞部出现放射痛，牙槽窝内空虚感，局部有腐臭味。若合并上述症状建议及时口腔科门诊就诊行创面清创术去除感染组织。若疼痛难以忍受，可口服布洛芬片缓解症状。