右侧卵巢巧克力囊肿是一种良性疾病，本身不严重，但具有恶性生物学行为，可发展为卵巢透明细胞癌，是引起痛经和女性不孕的主要原因之一，容易反复发作。如果发展为卵巢透明细胞癌就严重了。

卵巢巧克力囊肿可发生于左右两侧，主要由于子宫内膜细胞异位在卵巢上，每个月月经期该部位都会出血，出血在囊内聚集，形成囊肿。反复出血，囊肿会越来越大，里面的血变成陈旧性的，再混合一些子宫内膜腺上皮的分泌物，形成粘稠的巧克力色的液体，称为巧克力囊肿。

卵巢巧克力囊肿的治疗包括药物治疗和手术治疗两种方法，具体方式需要根据患者年龄、症状轻重、病变程度和对生育的要求选择治疗方案。

对于囊肿直径在4cm以下可以尝试药物保守治疗并定期随访检查。对于病变较轻的无生育要求或未婚妇女，建议口服孕激素治疗，如炔诺酮、甲地孕酮、醋酸甲羟孕酮等，也可选择口服丹那唑，使子宫内膜萎缩达到治疗的目的。

如囊肿直径持续≥5cm、严重的痛经或不孕、囊肿持续增大、超声检查提示可疑恶变、肿瘤标志物远远超出正常值、囊肿破裂引发急腹症、绝经后囊肿不缩小反而增大等就需要手术治疗。对于年轻有生育要求的患者，尽量切除病灶，保留子宫及一侧卵巢，做保守性手术；无生育要求者，可切除子宫及一侧附件或切除子宫和双侧附件做根治性手术。