附件囊肿包括输卵管和卵巢囊肿，什么情况下发生疼痛还需要看具体病变情况，如出现囊肿破裂、蒂扭转、感染等情况时可能会发生疼痛。

1、输卵管囊肿：是一种慢性炎症病变，多为良性，因病原体感染输卵管后引起炎症反应，使输卵管肿胀、渗出，最后形成积脓；当炎症反应消退后，输卵管中的脓液被组织吸收，脓液转变为清亮的浆液，形成了输卵管囊肿。大多数输卵管囊肿的患者通常是不会出现明显疼痛症状的，但如果是由于子宫内膜异位，产生的输卵管巧克力囊肿，会随着月经的周期性变化出现严重痛经症状；部分患者囊肿破裂，还可能会导致输卵管粘连，此时也会出现比较严重痛感；当患者合并慢性盆腔炎时，会有慢性盆腔痛，下腹坠胀感腰骶部酸痛；如果当输卵管囊肿> 5cm时，囊肿较重，当体位突然改变时(如从卧位突然坐起) , 囊肿容易发生扭转会引起急性腹痛、恶心、呕吐等症状。

2、卵巢囊肿：①功能性卵巢内囊肿主要是由月经周期造成的，通常不会损害健康，且很少引起疼痛，往往在2~3个月经周期内自行消失，但有时随着囊肿体积的增大，患者可能会感到下腹部不适、一侧下腹部隐隐作痛或疼痛比较严重症状。②非功能性囊肿，如囊腺瘤，是卵巢的良性上皮性肿瘤，其生长在卵巢表面，囊内可能充满了水样或黏液样物质；卵巢巧克力囊肿指子宫内膜异位囊肿，囊肿会逐渐侵蚀正常卵巢，如果不处理会越长越大，甚至破裂在盆腔内，上述情况在未得到及时的治疗时容易发生囊肿破裂、蒂扭转、囊肿破裂导致的合并感染等都会发生下腹部的不适、疼痛。