乳晕上有褐色的小疙瘩可能是正常生理现象，也可能是急性乳腺炎、乳腺囊性增生病等疾病引起的，应该根据不同的病因而采取不同的治疗措施；

1、正常生理现象：如果在生长发育期，乳腺腺体仍处于生长发育阶段，体内雌激素分泌增加，乳晕上会出现小疙瘩，当体内的雌激素水平较高，刺激人体黑色素细胞产生黑色素，此时小疙瘩会逐渐变为褐黑色。这是正常生理现象，通常不需要特殊治疗，只需要保守观察、减少触碰即可。

2、急性乳腺炎：是致病原侵袭导致的乳腺组织炎症，临床上可表现为乳腺局部的红、肿、热、痛，即可有明显的胀痛症状及局部肿块。当炎症波及范围较大时可有乳晕上有类似于小疙瘩的硬块。由于此时乳房有大量的炎症因子，使乳腺的代谢产物增加，从而导致代谢产物在乳腺上堆积，出现小疙瘩硬块出现褐色的表现。其治疗可以先局部使用抗生素软膏，如红霉素软膏、盐酸金霉素软膏、莫匹罗星软膏等局部涂抹。如果症状较重必要时需要在专业医师指导下静脉滴注抗生素，如注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠、注射用美罗培南、注射用头孢噻肟钠等，同时还需要定期清洗乳头及乳晕，保持乳房的干燥。

3、乳腺囊性增生病：此病为中青年女性常见的疾病，表现为乳腺小叶、导管高度扩张形成的囊肿样结构，其病因与内分泌失调相关，过量的雌激素分泌或受体敏感性增加均可导致乳腺组织异常增生。临床上以乳房肿块、疼痛及乳头溢液为主要表现，同时还有乳晕周围有小疙瘩硬块的症状。如果女性长期穿过紧的内衣，会导致乳头局部的皮肤受到摩擦的刺激，出现色素沉着，此时会表现为乳晕上小疙瘩成褐色。患者应规律作息、充足睡眠、避免精神紧张及情绪焦虑、适当运动、多摄食新鲜蔬菜水果、穿合适的内衣等，必要时可在专业医师指导下使用黄体酮软胶囊、枸橼酸他莫昔芬片、达那唑胶囊等药物治疗。如果症状严重时还可以采取乳房肿块切除术、乳房区段切除术、乳腺结节切除术等手术治疗。