肛门脓肿如果不手术，可以选择口服或静脉滴注抗生素治疗，常用的抗生素有头孢类、氧氟沙星类、甲硝唑等广谱抗菌素。临床上看， 无论是口服还是静脉滴注抗生素，效果都不是特别好。大部分患者经过保守治疗后，比如口服和静脉滴注药物，最后会选择手术治疗。因为肛周脓肿具有原发性内口，由内口进入致病菌，导致肛门周围组织的化脓性感染，需把脓腔打开，把脓液引出来，才能解除肛周脓肿的痛苦。在切开引流的基础上，扩大切开脓腔，处理内口，这种疾病才不会复发。

肛周脓肿是通过手术才能治愈的疾病，如果有条件最好采用手术治疗，会减少痛苦。