孩子口腔两侧有肉疙瘩，主要考虑是以下原因导致：腮腺导管口、牙齿外翘、口腔溃疡、扁桃体肿大等。可以根据肿块的大小、范围、形状以及与周围组织的关系，明确原因，进行针对性治疗。具体如下：

1、腮腺导管口：孩子口腔两侧有肉疙瘩，有可能是唾液腺的腮腺导管口，是口内排除唾液的重要途径，属于正常的组织结构，一般不需要进行特殊处理。

2、牙齿外翘：即咬合偏向颊侧，长期可能导致两侧颊黏膜被牙齿摩擦，而形成咬合线，可能导致颊部黏膜出现凸起，类似肉疙瘩，正常情况下就有，因此不需要治疗。

3、口腔溃疡：有些孩子考虑可能是存在口腔溃疡或者复发性口腔溃疡，发病初期其形态也会表现为口腔两侧有肉疙瘩。建议使用冰硼散或者口含西地碘含片治疗，平时可以使用罗红霉素胶囊、甲硝唑、藿香正气水进行处理。

4、扁桃体肿大：孩子的口腔靠近咽喉部位，口腔两侧有肉疙瘩考虑是扁桃体肿大引起。根据扁桃体肿大分为三度，平腭咽弓为一度，腭咽弓和中线之间为二度，超过中线为三度，根据不同的分类分型制定不同的治疗方案。一般超过二度，需要进行手术治疗，将肿大扁桃体切除，配合抗炎药物静滴治疗，如阿莫西林、阿奇霉素、头孢克洛等。