头皮上有小疙瘩用手摸有疼感可能是毛囊炎、皮脂腺囊肿、带状疱疹等疾病引起的，不同疾病的致病原因和治疗方法不同。

1、毛囊炎：大多由于感染金黄色葡萄球菌引起，少数为感染糠秕马拉色菌、皮肤癣菌引起。头皮局部外伤、血糖控制不佳、免疫力低下、长期使用免疫抑制剂、不注意个人卫生都可以诱发本病。表现为以毛囊为中心的小疙瘩，伴有疼痛。若是细菌感染引起的毛囊炎，可以外用抗生素类药膏，比如夫西地酸乳膏、复方多粘菌素B软膏、莫匹罗星软膏等。若是真菌引起的毛囊炎，可以外用抗真菌的药物，比如酮康唑洗剂、盐酸特比萘芬乳膏等。

2、皮脂腺囊肿：头皮皮脂腺分泌旺盛，皮脂腺导管堵塞后，皮脂腺分泌物容易聚集在毛囊内形成小疙瘩。过度搔抓皮损、不注意头部卫生、免疫力低下都可以导致囊肿感染，出现疼感。若有感染，可以外用红霉素软膏、甲硝唑凝胶、莫匹罗星软膏等。若皮脂腺囊肿较大，等炎症消退后，可以去医院行皮脂腺囊肿切除术治疗。

3、带状疱疹：头皮上的带状疱疹是由于机体免疫力下降后，潜伏在体内的水痘-带状疱疹病毒被激活，侵犯三叉神经引起。带状疱疹可以出现大致呈带状分布的红斑、丘疹、水疱，看起来就像小疙瘩。病毒侵犯神经会引起神经痛，所以用手摸有疼感。本病需要在医生指导下治疗，可以口服抗病毒药物，比如盐酸伐昔洛韦分散片、泛昔洛韦分散片、阿昔洛韦片等，还可以口服营养神经的药物，比如甲钴胺片、腺苷钴胺片、维生素B1片等。若有明显疼痛，可以口服止痛药，比如普瑞巴林胶囊、加巴喷丁胶囊等。处方药物需在医生指导下使用。