当出现指甲根部有凸起，按压疼痛的症状时，主要需要考虑血肿、毛囊炎、真菌感染等可能，需在明确病因后进行处理。

1、血肿：当患者指甲根部受到外力的撞击、击打、挤压等外伤后，皮下的毛细血管会发生破裂，血液就会在皮下淤积形成血肿，表现为凸起，按压时可有疼痛感。在处理方面，要做好患处皮肤的清洁工作，避免再次受到外界伤害，可适当对患处进行热敷来促进淤血的消退。

2、毛囊炎：当患者指甲根部的皮肤组织受到金黄色葡萄球菌等病原体的感染后，就会以毛囊为中心形成凸起，表皮可发红肿胀，按压时可有疼痛感。在处理方面，要保持患处皮肤的清洁，不要接触脏东西，建议外用夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏、复方多粘菌素B软膏等药物治疗。

3、真菌感染：当皮肤癣菌等真菌类病原体侵袭指甲根部的皮肤组织时，局部会发生炎性反应，引起脂质、角蛋白等物质的分解，局部就可出现丘疹、水疱等凸起，按压时疼痛。在治疗方面，可外用硝酸咪康唑乳膏、硝酸益康唑乳膏、盐酸特比萘芬乳膏等药物缓解症状，也可遵医嘱口服氟康唑片、伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等药物治疗。