小针刀治疗可能导致出现感染、血管损伤、神经损伤等副作用。

1、感染：小针刀在治疗肩关节周围炎、急性软组织炎的过程中，需要达到足够深的层次才可以达到治疗的效果，由于该治疗切口较小，如果相关器械以及操作部位消毒不及时、不彻底，或术后不注意卫生，会导致患者出现局部感染。

2、血管损伤：小针刀可以用来治疗狭窄性腱鞘炎、膝关节炎、肱骨外上髁炎等疾病。但由于人体血管丰富，在对以上疾病进行治疗的过程中有可能损伤血管。

3、神经损伤：小针刀在治疗颈椎病、腰椎间盘退出时，由于病变局部神经丰富，如果操作者对解剖结构不够了解，会出现神经损伤的可能。