抠肚脐眼第二天肚子疼，很有可能是由于抠肚脐眼出现感染引发的。但也不排除患者可能本身存在胃部疾病。

肚脐是人体生理性的凹陷，其中本身就含有污垢或者是其他的致病菌。如果用手去抠肚脐，很有可能导致周围皮肤损伤，容易引发感染的现象。出现感染之后容易导致第二天出现肚子疼的症状。针对细菌感染可以在医生的指导下使用抗生素类的药物治疗，如诺氟沙星、阿莫西林、头孢呋辛钠等。如果局部感染现象比较严重，也可以使用碘伏或者是酒精消毒处理。平时要注意做好局部的卫生护理工作，避免再次感染。

肚子疼也有可能是其他疾病导致，如慢性胃炎、胃溃疡等。针对病因不同，治疗的方案也是有差别的。慢性胃炎患者如果是幽门螺杆菌感染导致，需要在医生指导下采用四联用药治疗，如奥美拉唑、胶体果胶铋、阿莫西林、甲硝唑等。胃溃疡的患者可在医生指导下服用抑制胃酸分泌的药物治疗，如奥美拉唑、盐酸雷尼替丁、法莫替丁等。