肾结石微创手术有可能会发生后遗症。

如果是进行经皮肾镜肾脏结石碎石清石手术，可能会造成肾脏的损伤，造成继发性出血，严重时可引起失血性休克，需要手术止血治疗，甚至需要肾脏切除治疗等。如果是输尿管镜肾脏结石碎石手术，输尿管镜存在视野盲区，可能会出现肾脏结石清除不彻底，造成肾脏损伤引起血尿，也可能会损伤肾盂或者输尿管，严重的可能会造成输尿管黏膜的撕脱，甚至需要进行自体肾移植手术。