慢性浅表性胃窦炎可以选择四联方案或者是PPI类药物、H2受体阻滞剂、胃粘膜保护药、促胃肠动力药，及助消化药等药物治疗。

慢性浅表性胃窦炎主要是由幽门螺杆菌感染引起，患者可以做C13或C14呼气试验检查，明确有无幽门螺杆菌感染。如果结果阳性，可以选择四联方案，根除幽门螺杆菌治疗，就是一种PPI+2种抗菌素+1种铋剂，疗程是7天到14天。如果没有幽门螺杆菌感染，可以选择PPI类药物，包括奥美拉唑，兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、埃索美拉唑等，或者是H2受体阻滞剂，如西咪替丁、雷尼替丁，法莫替丁、尼扎替丁等，还可以选择胃粘膜保护药，如铝镁加混悬液、硫糖铝等，通过这些药物抑制胃酸，或者是中和胃酸，从而减少胃酸对胃粘膜的刺激，缓解症状，并促使炎症的恢复。如果患者有腹胀、早饱、嗳气反酸的症状，还可以选择促胃肠动力药，如多潘立酮，莫沙必利、伊托必利等治疗。还可以选择助消化药，如复方消化酶，复合维生素B等治疗。