大便后肛门有水样粘液，考虑是由于直肠息肉、直肠炎、肛瘘等疾病引起。建议查明原因后进行治疗。具体如下：

第一、直肠息肉，是指发生在直肠内壁突向肠腔内部的隆起性病变。该疾病会引起腺体增生，从而引起黏液分泌增多，所以会导致大便后肛门有水样粘液，严重的会伴有脓便或者黏液脓血便等症状，以及大便习惯改变、腹泻、大便次数增多、里急后重等临床症状。直肠息肉的治疗原则是小的良性息肉，特别是炎性息肉可以定期复查，不必立即治疗；对于大的腺瘤性息肉，鉴于该病属于癌前疾病，大多主张内镜下切除，如果内镜下切除比较困难可以考虑外科手术切除。

第二、直肠炎，直肠炎最主要的原因是因为腹部受凉、进食不洁饮食，导致细菌和病毒引起的肠道感染。该疾病会导致肠道黏液分泌增多，同时由于炎症刺激会导致肠道腺体分泌增多，因此会出现大便后肛门有水样粘液。常见症状还有大便次数增多、大便稀薄、黏液脓血便、腹痛、腹胀，部分人会有发烧的表现。治疗首先是提高机体的免疫力，同时应该注意饮食习惯，要增强运动，保持良好的心情，充足的睡眠，必要的时候可以使用益生菌，调理肠道菌群的药物，如乳酸菌素片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊、双歧杆菌四联活菌片等。如感染症状较重，也可口服消炎药如左氧氟沙星、环丙沙星、甲硝唑片等。

第三、肛瘘，肛瘘是肛周脓肿破溃或手术切排后导致的后遗症，由于肛周脓肿破了一个洞还一直流脓，如果破口长时间无法愈合，持续有脓液渗出，考虑肛瘘形成。该疾病属于感染性质的疾病，会使肛门周围的肌肉组织受到损伤，发生肛门的闭合不严，排过大便之后，肠道内的液体外溢，可以表现为大便后肛门有水样粘液，还有流脓、肿痛、瘙痒等症状。治疗方法有：抗感染治疗，如头孢克洛胶囊、阿莫西林胶囊、头孢丙烯片等控制感染；待感染控制后，需要行手术治疗才能够根治，低位的肛瘘采取瘘管切开或瘘管切除术，如果瘘管位置偏高的，行挂线术，瘘管非常成熟的，纤维化也非常明显，可以行LIFT手术。