扁桃体疼痛是因为扁桃体发炎。扁桃体是人体最大的外周淋巴组织，又位于口咽部，是人体免疫的第一道大门。扁桃体炎可分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎，治疗上：

1、保持口腔清洁，每天睡前刷牙，饭后漱口，以减少口腔内细菌感染的机会；2、含漱法，可选用淡盐水漱口，简单又方便。可以饭后及睡前，取温开水一杯加少许食盐，口感有咸味即可，反复漱口，每次五分钟左右；3、药物治疗，使用增强免疫力的药物，若为链球菌感染，可用长效的青霉素来进行治疗。加强体育锻炼，增强体质和抗病能力。

当保守治疗无效时，应采用手术疗法。扁桃体如果过度肥大，妨碍呼吸，吞咽困难者，也建议手术治疗。