半夜经常出现肚子疼，首先要考虑是否和十二指肠溃疡有关。十二指肠溃疡属于消化性溃疡，患者多伴有腹痛、腹胀、反酸、烧心以及恶心等症状，腹痛常具有周期性和节律性，患者常表现为饥饿痛或者是夜间痛，有时常在夜间痛醒。这时进行胃镜检查，常可以明确诊断。

除此以外，患者如果经常出现夜间腹痛，还应考虑和胃炎以及消化不良有关。这时患者还多伴有嗳气、早饱、呃逆、反酸、烧心、食欲不振等情况，这时需行胃镜检查，明确诊断。

此外，如果晚餐时，暴饮暴食，进食过多辛辣、刺激的食物，这时也有可能会导致夜间出现腹痛的情况。