第一次吃褪黑素第二天头晕可能是由于褪黑素的副作用导致的。但也可能并非吃褪黑素引起的第二天头晕，头晕还可能是体位性眩晕等疾病引起的。具体需根据病因对应处理。

1、由于褪黑素的副作用导致头晕：人体内的褪黑素是由脑松果体分泌的，属于吲哚杂环类的化合物，多储存在松果体内。其分泌具有明显的昼夜节律，白天的分泌会受到抑制，在晚上的分泌会比较活跃。褪黑素的主要作用是可以帮助睡眠质量的改善，可以缩短睡前的觉醒时间和入睡时间，会使得浅睡阶段短，深睡阶段得到延长，有较强的调整时差功能。当患者服人工合成的褪黑素时，可能会导致自身的褪黑素分泌节律失调，所以患者会出现第一天吃褪黑素第二天头晕的现象。出现这种情况，患者需要首先暂停服用褪黑素药物，养成良好的作息习惯，通常头晕症状可缓解。

2、体位性眩晕：体位性眩晕也称为良性位置性眩晕，也称为耳石症。病因较为复杂，部分病因不明，部分与神经及耳部疾病有关。患者一般表现为头部位置变动时，突然出现头晕，持续时间较短，多不超过1分钟。同时可以伴有看东西旋转，严重时也可能会出现恶心、呕吐。治疗方法主要为耳石复位。如果头晕的症状严重，可以进行对症止晕治疗，常用的药物有盐酸倍他司汀片、盐酸氟桂利嗪胶囊、盐酸地芬尼多片等。