肛门脓肿的用药要看是否形成脓肿，如果前期肛周感染，还没有形成脓腔，用药是头孢类的抗生素加上硝唑类的药物，比如头孢克洛加甲硝唑或替硝唑效果比较明显，可配合温盐水的坐浴，坐浴后涂抹百多邦一类的药物，输液的效果要比口服药物稍快。

如已形成脓肿，任何药物都没有作用，建议积极手术，可做肛周脓肿切开引流术，也可做切开引流加一期的挂线术，还有肛周脓肿一次性根治术，这些手术都比较成熟，但任何手术都不敢保证不复发，特别切开引流的复发率比较高，根治术的复发率比较低。