中枢神经系统的疾病很多，包括各种原因引起的头痛如原发性的偏头痛。

脑血管病如短暂性脑缺血发作。中枢神经系统变性疾病如运动神经元病、阿尔茨海默病。中枢神经系统感染性疾病如病毒性脑炎、脑膜炎等。中枢神经系统脱髓鞘疾病如多发性硬化、视神经脊髓炎。运动障碍性疾病如帕金森病、肝豆状核变性、小舞蹈病。脊髓疾病如脊髓炎、脊髓出血。神经肌肉接头处疾病如重症肌无力。神经系统遗传性疾病如遗传性共济性失调，腓骨肌萎缩症。