喉咙不舒服并且有咳嗽的表现，这种情况可能是由慢性咽炎、慢性鼻窦炎、胃食管反流病等因素引起的，具体原因如下：

1、慢性咽炎：是咽部黏膜的慢性炎症，与细菌感染、职业、环境等因素有关。这时由于慢性因子对咽喉黏膜的刺激，会引起黏膜敏感性增强，同时黏膜分泌物增多，这时就会引起喉咙不舒服、咽干、咳嗽的表现。

2、慢性鼻窦炎：是感染或非感染因素导致的鼻窦慢性炎症。由于慢性炎症的刺激，患者通常会有间歇性、持续性的单侧或者双侧鼻堵，会有嗅觉减退、鼻源性头痛、脓鼻涕或者鼻涕倒流等表现，分泌物反流入喉咙后就会引起喉咙不舒服、咳嗽、咳痰的表现。

3、胃食管反流病：是指胃内容物反流至食管引起的不适症状和（或）并发症，这时由于胃酸分泌异常和食管下括约肌功能障碍，胃酸及胃内容物就会反流至喉咙处，其刺激声门处就可能引起咳嗽，这时患者就会伴有喉咙不舒服、咳嗽、反酸烧心等表现。