结缔组织病不同的患者表现的症状不一样，最常见症状是骨骼、关节和肌肉疼痛；患者可以出现脱发、口腔溃疡，以及光照后皮肤过敏等症状；部分患者会出现雷诺现象，就是双手遇冷会出现变白变紫等症状。

合并系统受累的患者，会出现其他系统相关的症状。比如消化道受累，可能会出现腹痛、腹胀、消化不良，以及腹部包块等症状；合并呼吸道受累，比如间质性肺炎的患者可以出现干咳、胸闷、气短、劳动耐力下降等症状；合并血液系统的患者可以出现贫血、血小板减少等，导致皮肤黏膜出血。