腹泻和便秘交替的形成机制是肠功能紊乱。不管是炎症引起，还是单纯的肠功能紊乱，都会出现腹泻和便秘交替出现的症状。常见于肠结核、炎症性肠病、结肠癌、肠易激综合征等。

肠结核是结核分枝杆菌引起的肠道慢性、特异性感染，常继发于肺结核。临床表现为右下腹或脐周腹痛，大便习惯改变，可以表现为腹泻与便秘交替、腹部肿块等，还可以出现长期不规则低热、盗汗，消瘦、贫血和乏力等症状。炎症性肠病是一类多种病因引起的，免疫异常介导的肠道慢性及复发性炎症，有终生复发倾向。结肠癌是常见的恶性肿瘤，是遗传因素和环境因素综合作用的结果。患者表现为腹泻与糊状大便，或腹泻与便秘交替。肠易激综合征是一种以腹痛或腹部不适，伴排便习惯改变为特征，而无器质性病变的常见功能性肠病。

患者可以做肠镜检查，明确诊断。