霉菌性尿道炎建议使用抗霉菌治疗的药物。如果在使用抗菌素，最好将抗菌素停掉。

抗霉菌治疗的口服药物，包括制霉菌素、大扶康、大蒜素等，一般需要使用3到5天，再复查尿常规，观察是否仍然有霉菌存在。

在治疗期，鼓励大量喝水，每天的喝水量要大于2000毫升。同时可增加中成药口服，比如三金片、癃清片、热淋清等，可快速促进炎症的排泄。建议每天注意个人卫生，及时清洗会阴部、尿道口，不要发生不洁性行为。霉菌治疗的药物不能使用时间太久，很多霉菌药物对肝、肾损伤比较大。