呆小症的早期症状通常可以表现为喂奶困难、便秘、哭声嘶哑、嗜睡、发育生长缓慢，以后逐渐会出现腹胀、腹部膨隆、皮肤干燥缺乏营养、头发以及指甲生长迟缓。随着病情的进一步发展，甲减征象会逐渐增多，病情日渐严重，可以出现鼻短上翘以及鼻梁塌陷、唇部变厚、舌体变大、牙齿发育不良、智力发育障碍、身体增长缓慢、头大而四肢较短、骨龄出现延迟，青春期时性腺发育可以明显延迟。

呆小症出现临床症状的时间一般为出生后3到6个月，出生时体重较重，通常不活泼，然后逐渐会发展为典型的呆小症。如果起病越早，通常预示病情越重。