首先查找病因。引起新生儿拉肚子的病因，有感染性和非感染性两大因素。感染性常见的有病毒和细菌感染；非感染性常见的是饮食方面的因素，见于喂养不当引起的。吃了过多的乳类或者过早添加辅食，或者对牛奶蛋白过敏，或者一些原发性双糖酶的缺乏引起的。非感染性因素当中，还有些气候的因素，像天气突然变冷、变热、腹部受凉等等，都可能引起宝宝拉水。

如果是细菌感染引起的，给予抗生素；如果是喂养不当引起的，就要调整饮食，不要一下子给新生儿喂太多，不要添加辅食；如果对牛奶蛋白过敏的，要改成深度水解蛋白或氨基酸奶粉喂养；如果是双糖酶缺乏的，改成无乳糖奶粉喂养。建议要注意新生儿腹部的保暖，可以口服调节肠道菌群的益生菌，可以给新生儿喂一些口服补液盐，可以防止脱水和电解质紊乱。