引起小肚子疼的原因有很多。如果没有其它的症状，首先考虑是女性生理周期，也就是月经期导致的疼痛；男性通常考虑是房事过多引起的，以及前列腺炎所引起的。如果同时伴有腹胀、腹泻，一般考虑可能是急性肠炎，如果还伴有发热、食欲不振，一般考虑盆腔炎以及阑尾炎所引起。

所以，如果在小肚子疼痛时到医院做相关的检查，就可以进一步明确诊断是什么原因所引起的，然后再对症处理，积极治疗。