肛门闭锁产检能不能查出来，要根据不同的情况来判断。如果是隐匿性的肛门闭锁，一般产检是查不出来的；如果是显性的肛门闭锁，在做b超时，恰巧胎儿暴露出肛门的位置，产检就有可能发现。

肛门闭锁是一种新生儿常见的畸形，由于位置比较隐蔽，所以在整个孕期的各项排畸检查中，不一定能够发现的了。如果产后发现新生儿出现了肛门闭锁的情况，可以尽早选择外科肛门闭锁手术来进行治疗，这个手术在临床经常做，技术成熟，比较简单，创伤小，也相对比较安全，效果也非常好，家长术后要注意帮助患儿做好排便训练，帮助患儿养成良好的排便习惯。建议孕妈整个孕期要避免接触有害物质，比如放射线、有毒有害气体、或者各种药物等等，以免导致胎儿畸形。