慢性结肠炎有轻有重，其严重程度由引起慢性结肠炎的病因和患者的抵抗力决定。

慢性结肠炎常由肠结核和炎症性肠病多见。炎症性肠病包括溃疡性结肠炎和克罗恩病；肠结核是由结核杆菌引起的慢性肠道炎症。炎症性肠病主要是属于免疫异常所导致的慢性肠炎，具有反复发作，终身反复的特点。肠结核可以给予抗结核药物治疗，疗程是半年到九个月，一般按疗程治疗之后，肠结核是可以治愈的，并不严重。如果是炎症性肠病，则比较难治愈，有很多患者需要终身维持治疗。克罗恩病常容易引起穿孔和肠瘘，是属于比较严重的慢性结肠炎。