检查肛门HPV病毒，可以通过视诊、肛门镜检查、醋酸白试验、病理组织检查等检查手段。

HPV病毒可以引起人体皮肤的鳞状上皮增殖，如果肛门处感染HPV病毒，在肛门外侧皮肤可以发现有疣体存在，所以通过视诊可以初步判断，而且通过肛门镜检查，也可能会看到肛门里面有疣体生长。如果存在，可以进一步进行醋酸白试验，由于HPV感染的上皮细胞和正常细胞产生的角蛋白不同，在经过醋酸的作用后，其病变部位的蛋白质会出现脱色变白，而正常部位通常不会变白，但也会出现一定的假阳性。或者切除疣体组织，做病理组织活检，如果发现表皮棘层肥厚，出现乳头瘤样增生，并且可以在颗粒层及棘层上部见到凹空细胞，就基本可以确诊为患有HPV病毒。

临床一旦确诊感染HPV病毒，建议及时进行治疗，如果存在疣体的，可以在医生指导下使用外用药物，比如水杨酸软膏、斑蝥素乳膏等药物，或者在皮损内使用注射用盐酸平阳霉素、维生素D3注射液等药物，或者采取物理疗法，有冷冻、激光、微波等方法，可以使疣体发生坏死。对于肛门处较大的疣体，可以考虑手术切除，术后定期到医院复查。治疗期间，严格注意禁止进行性生活，避免发生接触性传播。