引起咽炎的病因不同，发热持续的时间也不同。咽炎属于急性上呼吸道感染，可以由病毒或者细菌感染引起。

病毒性引起的称为病毒性咽炎和喉炎、疱疹性咽峡炎、咽结膜热等。病毒性咽炎临床特征为咽部发痒和灼热感，疼痛不持久，也不突出，当有吞咽疼痛时，常提示有链球菌感染，咳嗽少见。疱疹性咽峡炎临床表现为明显咽痛、发热，病程约为1周。眼结膜热临床表现为发热、咽痛、畏光、流泪，咽及结合膜明显充血，病程4至6天。

细菌感染引起的常见于细菌性咽扁桃体炎，多由溶血性链球菌引起，其次为流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、葡萄球菌等，起病急，明显咽痛、畏寒、发热，体温可达39度以上。细菌性的咽炎，经过有效的抗菌治疗，如选择青霉素、头孢、克拉霉素等治疗之后，发热可以迅速缓解，体温可在1至3天之内下降。