急性上呼吸道感染若不及时治疗可以向下导致支气管炎和肺部的感染，还可以导致心肌炎发生。

急性上呼吸道感染可以继发中耳炎，鼻窦炎，咽后壁脓肿，扁桃体周围脓肿，颈部淋巴结炎，喉炎，气管、支气管炎，肺炎等，以婴幼儿多见。病毒感染可以并发急性病毒性心肌炎，可以导致心力衰竭、心律失常，甚至猝死。A组溶血性链球菌感染可以继发急性肾小球肾炎和风湿热。急性上呼吸道感染还可以出现热性惊厥。出现上呼吸道感染以后，需要及时查血常规，监测体温，找出感染的部位，及时选择敏感的抗菌的药物或者抗病毒的药物，及时避免并发症的发生。