肛管鳞癌的主要表现取决于患者的临床分期。肛管鳞癌早期，一般病人没有明显的症状。到了中晚期，最主要的表现为肛门持续性疼痛。其次，表现为肛门的坠胀不适，伴有粘液脓血便，有的病人排便习惯会改变、肛门瘙痒伴有分泌物等等。另外，患者可以发生恶病质，其他远处转移相应的症状，比如说转移到胃肠，患者可以出现恶心、呕吐等消化道症状。

肛管的直肠指检以及活检是肛管癌的主要的检查方式。肛管鳞癌早期首选手术治疗，术后根据病理的检查结果以及免疫组化的结果，判断是否需要进一步采用化疗或者是放疗等等，中晚期以化疗、放疗等非手术治疗为主。