梅毒3周的时候检查阴性，是不能完全排除的。

人体感染梅毒螺旋体之后，体内的免疫系统会产生很多针对梅毒螺旋体的抗体，通过检测这些抗体，就可以推知患者是否是感染了梅毒。但是，梅毒螺旋体抗体的产生是需要一定的时间的，一般是4到6周左右，长的可能需要3个月，短的可能2周。如果检测的时间太短，血里面的梅毒螺旋体抗体可能还没有来得及产生，或者是虽然产生了，但是还达不到检测所需要的浓度，所以就检测不出来。在3周左右的时间进行检测，时间比较短，如果是阴性，并不能完全排除梅毒。建议最好2-3周之后，再重复的检查一次，如果还是阴性，基本上就可以排除了。