脑干病变很多表现为交叉性瘫痪及病灶侧脑神经受损和对侧肢体中枢性瘫痪及感觉障碍。病变水平的高低可以根据受损脑神经的症状进行定位。例如，第三对脑神经麻痹的病灶在中脑；第五、第六、第七、第八对脑神经麻痹的病灶在脑桥；第九、第十、第十一、十二对脑神经麻痹的病灶在延髓。

脑干病变多见于血管病、肿瘤和多发性硬化，炎症等等。脑干损伤常见的临床综合征有：延髓背外侧综合征、延髓内侧综合征、脑桥腹外侧综合征、脑桥腹内侧综合征、闭锁综合征、大脑脚综合征、脑桥被盖下部综合征、红核综合征等等。

脑干病变的临床表现及严重程度以及预后，根据不同的具体部位及病灶大小差别很大，一定要及时就诊，保证最佳的治疗效果。