黄金微针的后遗症主要在于灼伤皮肤，并且引起感染等情况。

在进行黄金微针的过程中，针扎进皮肤之后会有射频波形成，进而就会发出很高的能量，从而对皮肤产生刺激和损伤，促进胶原蛋白等成分的再生，使皮肤重塑。在此过程中，皮肤可能被能量灼伤，出现发红、肿胀、疼痛等情况，严重的时候还会发生局部乃至全身感染。如果灼伤情况比较严重，后期可能留下难以消退的色素沉着，甚至会留下瘢痕。