肚子胀痛首先需要明确病因，然后再做针对性的治疗。引起肚子胀痛可以是因为功能性的胃肠病或者是器质性的胃肠道疾病所引起。功能性的胃肠道疾病，包括消化功能不良或者是肠易激综合征。慢性的胃肠道器质性疾病包括慢性胃病，如慢性胃炎、胃食管反流病、消化性溃疡、胃部肿瘤如胃癌、胃淋巴瘤等。慢性的肠道疾病主要是肠结核、溃疡性结肠炎、克罗恩病、结直肠癌、肠易激综合症等。患者可以通过做胃肠镜检查明确诊断。

内镜检查是明确功能性和器质性肠道疾病的最重要的检查手段。引起慢性胃病的病因，常见于幽门螺杆菌感染患者，还可以做碳十三或碳十四呼气试验检查，明确有无幽门螺杆菌感染。如果结果阳性，可以选择四联方案根除幽门螺杆菌治疗，就是一种PPI加两种抗菌素加一种铋剂，疗程是七天到十四天。如果没有幽门螺杆菌感染，可以选择PPI类药物、H2受体阻滞剂、胃粘膜保护药、促胃肠动力药及助消化药等治疗。

如果是肠结核，可以选择抗结核药物治疗。如果是炎症性肠病，可以选择水杨酸类药物、糖皮质激素、细胞免疫抑制剂治疗。如果是直肠癌，患者尽量采取手术治疗。如果晚期不能手术的患者，可以选择化疗，再辅助靶向治疗、免疫治疗等。如果是肠易激综合征，主要是要患者认清疾病的性质，放松心情，保持良好的心态和选择对症治疗。