慢性胰腺炎的治疗目标主要控制血糖和调理消化功能，可以给予降糖药或胰岛素治疗糖尿病；予复方消化酶治疗外分泌消化功能不良的症状。这些治疗只能缓解症状，不能根除，需要终身维持治疗。

慢性胰腺炎的患者存在内分泌功能紊乱和外分泌功能紊乱。

内分泌功能紊乱可能导致糖尿病。外分泌功能紊乱可能引起消化功能不良。胰腺外分泌主要分泌胰酶，包括淀粉酶、脂肪酶、蛋白酶。如果这些酶缺乏会引起食物中脂肪油脂分解、消化能力下降，食物不能被充分消化吸收而出现脂肪泻、腹痛等症状。