正常情况下肛瘘手术是没有风险的，但如果患者有麻药过敏史，或者在不正规的医院进行治疗会有相应风险。

因为肛瘘是一种常见的肛门部疾病，一般会在骶管麻醉下或者是连续硬膜外麻醉下，行肛瘘剔除术或者是肛瘘挂线术，在手术后给予规律换药，还有坐浴治疗，该疾病可逐渐好转。不过如果患者既往有麻药过敏史，可能在麻醉时出现血压下降等相应风险。部分患者如果是在不正规的医院进行治疗，可能会导致肛门部括约肌被切断过多，而形成肛门部明显松弛，此时就不能够控便。

所以患有该疾病后，建议去正规医院的专科，例如普外科或者是肛肠外科进行治疗，医生会给予合理的处置。