新冠通常不会引起扁桃体发炎，但是有可能会伴随或者继发扁桃体发炎。

扁桃体发炎多是因为细菌感染上呼吸道而形成的扁桃体局部化脓性炎症，当患者有急性化脓性扁桃体炎时，多提示有细菌感染。而新型冠状病毒感染的部位主要在下呼吸道，较少感染上呼吸道。虽然部分新型冠状病毒感染者可以出现咽喉部的疼痛、瘙痒等不适，但一般不是急性化脓性扁桃体炎。少数新冠病毒感染者可能引起抵抗力和免疫力的下降，伴随或者继发细菌混合感染而出现扁桃体发炎。