病毒性角膜炎最基本的治疗方法是抗病毒治疗，包括局部使用一些抗病毒的滴眼液，比如阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦滴眼液、干扰素滴眼液等；还包括口服抗病毒药物，如阿昔洛韦、伐昔洛韦、更昔洛韦等能够抑制病毒的复制，减轻病毒对角膜的损伤。

常见的引起病毒性角膜炎的病毒是单纯疱疹病毒最多，带状疱疹病毒也有。它们都对这些抗病毒药物还是比较敏感，所以积极的加用抗病毒药物治疗，这是最基本的。其次为了预防感染也可以加一些抗菌素的眼药水，比如氧氟沙星滴眼液、氯霉素滴眼液等。到后期也可使用一些促进修复的抑制炎症滴眼液，包括一些含有地塞米松等激素类的滴眼液，以及含有生长因子（贝复舒）等滴眼液，对于治疗病毒性角膜炎都是有帮助的。