心内膜炎主要有感染症状、心脏体征、栓塞症状三大症状。

发热是心内膜炎最常见的症状，几乎所有的患者都有过不同程度的发热，热型不规则，热程较长。

约80%～85%的患者可以闻及心脏杂音，可由基础心脏病和（或）心内膜炎导致瓣膜损害所致。原有的心脏杂音可因心脏瓣膜的赘生物而发生改变，出现粗糙响亮、呈海欧鸣样或者音乐样的杂音。

栓塞症状可以表现为皮肤栓塞、指趾屈面、内脏栓塞、肺栓塞以及脑动脉栓塞等，因栓塞部位不同而出现不同的临床表现，一般发生于病程后期，但约1/3的患者可为首发症状。