导致龟头部位长水疱的疾病包括：生殖器疱疹、过敏性疾病、寄生虫相关疾病等。

首先需要注意的是生殖器疱疹，是由单纯疱疹病毒感染所引起的性传播疾病，通常是通过不洁的性行为而感染单纯疱疹病毒，经过一段时间潜伏期之后，在龟头、外阴部位就会形成群集的或者散在性的水疱，有灼热、刺痛感，需要进行抗病毒治疗才能好转，但是容易复发。另外，还有其他疾病，比如过敏性疾病也可以导致龟头部位出现水疱，比如固定性的药疹或者是过敏性多形红斑的损害，也可以导致龟头黏膜部位出现水疱。有时候甚至寄生虫，比如疥螨等叮咬局部，也可以形成龟头部位的水疱样的皮损。所以需要及时到医院，由有经验的医生来加以分析和确诊。