先天性胆道闭锁是可以治疗的，但其预后与患儿的闭锁程度和身体状况有关。

如果能够尽早的行胆肠吻合手术，这时肝脏的损伤还可以逆转，不会出现严重的肝硬化；如果肝内的胆道完全闭锁就需要行肝脏移植。但是目前肝脏的供体较少，如患儿与父母或近亲属的血型一样，可以尝试亲体肝脏移植，但该术式相对创伤很大，同时花费较高，术后患儿需要继续应用抗排斥药物，还需要其他支持治疗，随着时间的延长，可能还需要再次行肝移植等。