孕酮低会影响怀孕。在性激素六项的检查结果当中，提示孕酮偏低，则代表黄体功能不全，对女性的月经和备孕、怀孕都会有一定的影响。黄体功能不全会导致女性不容易怀孕，或在怀孕以后可能会引起反复的先兆流产、胎停或流产等，最严重的还可能导致女性的不孕。

孕酮低需要积极治疗，再进行追踪复查孕酮水平。如果复查性激素六项以后，孕酮的水平正常，则可以进行正常的备孕。怀孕以后，孕酮在前三个月内比较关键。如果这时孕酮持续性偏低，有可能会导致流产，甚至胚胎停育的发生。建议女性在发现自身孕酮低时，就应该及时前往医院，在医生的指导下使用药物来给予治疗。