腘窝囊肿通过艾灸一般不可以消除，艾灸只是一种常用的理疗方式和方法，可以改善血液循环、减轻疼痛。但是，腘窝囊肿的发生，多是由于关节内的积液进入到腘窝导致，艾灸并不能消除积液，也不能促进积液的吸收，起不到根本的治疗作用。具体内容如下：

腘窝囊肿如果不大的话，腘窝囊肿即腘窝内滑液囊肿，多由由慢性膝关节病变引起的，可表现为腘窝区的肿胀、疼痛、活动受限。囊肿的治疗一般以穿刺抽液或手术拨除为主。艾灸对囊肿的效果不大，但对慢性膝关节病变有改善作用，间接地减轻了囊肿发病的诱因。

如腘窝囊肿比较小，没有出现明显的疼痛和活动受限，可以先进行观察。如果生长过快，引起了明显的疼痛、活动受限。可以去本地正规医院的骨科就诊，由专业的医生采取手术切除，并且要消除关节通向腘窝的通道，防止出现复发。