女性在怀孕45天时想要流产，可以进行药物流产，也可以进行人工流产手术，因为药物流产最佳时间是在怀孕49天以内，人工流产最佳时间是在怀孕六到七周左右。

　　但是不管选择哪种流产方式，在进行流产前都需要做全面的身体检查，首先需要确认是宫内妊娠，其次要根据检查的身体情况来选择合适的流产方式。