肠道菌群失调的症状，一般可以表现为腹泻，不规律的腹泻以及便秘，还有的人腹泻、便秘交替出现，除此以外还长期腹胀，排气多，嗝逆、打咦，消化不良，所吃的食物往往吃进以后有饱胀感，而且持续的不容易感到消化了，说明胃和肠蠕动的功能是受限的。

　　还表现为患者的大便不成型，或者是有某些不消化的成分。肠道菌群失调，也可以削弱免疫力，使患者的免疫功能比一般人差。

　　由于肠道菌群失调时的便秘，患者毒素的排泄障碍，可以表现出皮肤的灰暗，色素斑点样的沉着增加等这样的一些表现。